南京市第一医院（南京医科大学附属南京医院、中国药科大学南京市第一医院），是原卫生部首批三级甲等综合性医院。医院创建于1936年2月，现有1个主院区和2个分院区（南院和河西院区），在职职工3405人，编制床位2600张，占地面积8.56万平方米，建筑面积21.36万平方米。2022年，医院诊疗总人次215.54万人次，出院人次8.31万人次。医院设有南京医科大学第三临床医学院、中国药科大学南京市第一医院、南京市心血管病医院、国家药物临床试验机构、国家首批心脏移植准入医院、国家首批工伤康复试点机构、国家良性前列腺增生健康管理基地等。

医院科室设置完善，现有国家级医学重点学科1个，国家临床重点专科1个，江苏省医学创新中心1个，省级医学重点学科6个，省级创新团队6个，省级临床重点专科19个，省专科（病）诊疗中心1个，南京市医学重点专科15个，南京医科大学重点学科4个，南京医科大学重点学科优选学科1个。设有国家级博士后科研工作站1个、院士工作站3个。

医院教学体系完整，设有临床学位分委员会1个，教学督导室1个、临床能力培训中心1个、教研室20个；现有博士点14个、硕士点30个；博士生导师26人、硕士生导师153人；教授31人、副教授101人。现有含住院医师规范化培训基地在内的国家级培训基地6个、省级培训基地5个。每年在院培养博士生、硕士生、本科生、进修生、住院医师规范化培训等各类学员1200人。

医院医疗设备先进，拥有百万元以上设备150余台，包括：正电子发射型磁共振成像系统（PET-MR）、112环数字光导PET-CT、直线加速器系统、同位素单光子发射计算机断层扫描仪（ECT）、3.0T磁共振断层扫描仪、双源CT、多层面螺旋CT、数字血管造影系统（DSA）、数字化X线成像系统（DR）、飞秒激光系统、准分子激光系统、光学干涉断层成像系统和数字化手术室系统等先进设备。

2015年起，医院积极探索建立上下联动、双向转诊的分级诊疗医联体模式，与秦淮区政府、雨花台区政府、建邺区政府等签署医联体合作协议，通过托管病区、业务指导、远程会诊、慢病管理、建立远程检验检查中心，促进优质医疗资源下沉，所做工作被江苏省医院协会评为优秀案例。现有院府合作8个、医联体成员单位40余家、专科专病联盟2个、市级基层特色科室孵化中心2个。2002年，通过英国BSI太平洋公司医院ISO9001质量管理体系认证；2013年，医院在全省范围内首家通过英国保柏集团的“管理质量服务(MQS)”银级认可。2021年，成功获评国家卫生健康委互联互通成熟度四级甲等。